A、当一个是底角是45°,一个是顶角是45°时,两三角形就不全等,故本选项正确;B、∵有一个角为100°,腰长相等的等腰三角形,∴100°的角只能是顶角,根据SAS即可推出两三角形全等,故本选项错误;C、∵周长相等,并且三角形是等边三角形,∴根据等边三角形的性质得出三边分别相等,∴根据SSS可推出两等边三角形全等,故本选项错误;D、根据SAS可推出两直角三角形全等,故本选项错误;故选A.