主要区别在两点：（一）使用范围不同。服务业发票是在服务业这一特定行业范围内使用,商业发票则是在商业这一特定行业范围内使用，两种发票均不得跨行业，超范围使用。（二）管理归属不同。服务业发票由地税机关负责管理，商业发票由国税机关管理。另外，两种发票在其印制的名称、内容、格式以及字轨编号、防伪标志上也有诸多不同之处。
