先确认证通过的时间，如果是10月份，那必须在这个11月征期申报抵扣（当月认证必须当月抵扣）。你们通过自行网上认证，想必也应是网上申报吧，各省使用的网上申报平台不同，国税机关使用的CTAIS(征管信息系统)的版本也不尽相同，处理的方式也不尽相同，最好的方法是和税务机关进行沟通，他们帮助解决。
