A、水稻F1花药经培养获得单倍体，用秋水仙素处理幼苗使染色体加倍，获得基因型纯合新品种，属于单倍体育种、原理是染色体变异，A正确；
B、让抗虫小麦与矮秆小麦杂交，得F1再自交，从F2中选出抗虫矮秆小麦，属于杂交育种、原理是基因重组，B正确；
C、利用基因工程技术将含抗病基因的重组DNA导入玉米细胞，经组织培养可以获得抗病植株，C正确；
D、用射线照射大豆使其基因结构发生改变，产生新的基因，从而获得种子性状发生变异的大豆，属于诱变育种、原理是基因突变，该处理可以大大提高基因的突变频率，但是不能改变基因突变的不定向性，D错误．
故选：D．
内容全部来源于网络收集，如有侵权，请联系网站删除：QQ：24596024