福建省农业科学院现设有13个研究所,即:稻麦、果树、甘蔗、茶叶、植物保护、土壤肥料、畜牧兽医、耕作轮作、地热农业利用、数字农业农业研究所和红萍研究中心、生物技术研究中心、中心化验室。在职职工1065人,离退休人员540多人。在职人员有高级科技人员185名、中级科技人员264名,国家级专家4名,省级专家11名。享受国务院特殊津贴67人。现有博士12人,正在攻读博士学位22人。