首先不合格的疫苗可能是，病原微生物灭活不彻底，导致所注射的疫苗制剂中所含的病毒毒力超标。这种情况下产生的后果，与感染相应病原微生物的后果是差不多的。第二个可能不合格的原因是，疫苗的存储或运输过程不严格，导致疫苗制剂失去应该有的作用，就等于跟没有接种疫苗一样。如果第二次接触病原微生物时，就和没有接种疫苗的正常人一样暴露于病原微生物。具体有什么后果，还要看所感染病原微生物的种类。
