解:连A1B,沿BC1将△CBC1展开与△A1BC1在同一个平面内,如图所示,
连A1C,则A1E与BC垂直时的长度就是所求的最小值.
在三棱柱ABC-A1B1C1中,AA1⊥底面A1B1C1,底面为直角三角形,∠ACB=90°,AC=CC1=1,BC=
,
2
∴BC1=
,A1C1=1,A1B=2,BC=
3
,CC1=1,
2
即∠A1C1B=90°,∠A1BC1=30°,
又∵sin∠CBC1=
,cos∠CBC1=
3
3
,
6
3
故sin∠CBA1=
,3+
6
6
故A1E=3+