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有的学者认为贝加尔湖以前是海洋，以后发生地壳运动，周围高山隆起，它却相对下降，形成了湖泊。以后，周围众多的河流汇入湖泊，渐渐地冲淡湖水，使之成为淡水湖，结束了它作为海洋的历史。原来大多数生活在海洋中的海洋生物灭绝。但是，有些生存能力特强的动物，慢慢地适应了淡水环境，成为世界上特有的淡水动物，如贝加尔海豹等。
也有学者认为，贝加尔湖中的淡水类海洋动物，有可能是从海洋中慢慢到达贝加尔湖，逐渐习惯了淡水中生活，便形成了淡水湖中的“海洋动物”。
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