设计院有许多门类，根据不同门类有不同的管辖部门，并且设计院还要看是独立设计院，还是企业的设计院，企业设计院归所属企业管辖，独立设计院有的归行业协会管辖。
道路交通工程的设计院归交通部管辖；市政工程设计院归市政管理局管辖；只有建筑设计研究院归建设部管，地方上也就是建设局管辖。
设计院，更多属于事业单位。或者国有企业等的下属企业。注册都是属于工商局管辖，业务各有各的管辖，不能笼统说。
我在北京，北京的所有设计院都归勘察设计测绘办公室管，简称勘测办，勘测办归北京市规划委员会管。
现在的设计院很多都私有化了
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