A、采用样方法的样方大小一般为100cm×100cm,但该实验不适于用样方法,A错误;B、许多土壤小动物有较强的活动能力,而且身体微小,不宜采用标志重捕法调查,常用取样器取样的方法进行采集调查,B错误;C、常用取样器取样的方法进行采集调查研究小动物类群的丰富度,C正确;D、土壤小动物对土壤中动植物遗体的分解有重要的辅助作用,实验结束后,还存活的小动物最好放回原地,D错误.故选:C.