A、血液中的红细胞容易变形破裂不是镰刀型细胞贫血症产生的根本原因，A错误；B、镰刀型细胞贫血症产生的根本原因是控制血红蛋白合成的基因中的一个碱基对发生了改变，B正确；C、血红蛋白中的一个氨基酸不正常是镰刀型细胞贫血症产生的直接原因，C错误；D、信使RNA中的一个碱基发生了改变不是镰刀型细胞贫血症产生的根本原因，D错误．故选：B．
