国家税务总局公告2011年第50号 《关于逾期增值税扣税凭证抵扣问题的公告 》
一、对增值税一般纳税人发生真实交易但由于客观原因造成增值税扣税凭证逾期的，经主管税务机关审核、逐级上报，由国家税务总局认证、稽核比对后，对比对相符的增值税扣税凭证，允许纳税人继续抵扣其进项税额
第二条列出客观原因，包括
（五）由于企业办税人员伤亡、突发危重疾病或者擅自离职，未能办理交接手续，导致增值税扣税凭证逾期；
所以你现在面临的问题是如何与税务局沟通，通过税务局审核，并逐步提交 到国税总局
实际工作中，没有哪个公司会因为这些原因成功办理抵扣，因为取证难，审核难。
除此之外，没有别的补救办法。
个人认为回天乏术了，过期的就是过期的，全额入成本吧。
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