A种群具有空间特征，包括随机分布、集群分布和均匀分布，A错误；B、森林植物的垂直分层主要与光照有关，B错误；C、调查种群密度常用的方法的样方法和标记重捕法，C错误；D、进行土壤中小动物类群丰富度的研究时，由于土壤中的小动物一般都体积较小、活动能量较强，不适宜采用样方法和标记重捕法，因此常用取样器取样的方法进行采集、调查，D正确．故选：D．
