化肥养鱼存在“四大危害”：
一是氨氮危害。由于化肥养鱼在水库中投入了尿素、氨水等化肥，将导致水体中氮氨含量超标，给人类身体健康带来危害。
二是硝酸盐。如果在养鱼水体中长期施用氮素化肥，则氮就会以硝酸盐的形式存在。硝酸盐含量过高就会引起人体变性血红蛋白症。亚硝酸盐和亚硝酸态氮进入浮游生物（藻类、菌类、寄生虫等）体内，被鱼类摄食后可在体内积累。表现症状为鱼鳍，鱼鳞充血。这些物质还能与胺类反应，生成具有致癌物质，人若食用对人体健康威胁很大。
三是砷危害。水库长期施用过磷酸钙和硫酸钾，就会形成砷的积累，水库水排放到自然水域中或用来灌溉就增加了对自然环境的毒害。
四是酚类危害。由于过量施用化肥培育水质，水体中就会合成一部分酚类化合物，其中苯酚对人类毒性较大，能使蛋白发生变性和沉淀，对动物（人类）各种细胞都有直接毒害作用。
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