医院始建于1940年，原隶属于中央特大型有色金属生产企业—云南锡业公司，1951年定名为云锡职工医院，1990年更名为云锡总医院，2003年6月30日从云南锡业集团有限责任公司剥离，移交红河州人民政府管理。
